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阪大 情報科学研究科 生物情報 2023年度 院試 過去問 解答例・解説

大学
大阪大学
研究科・専攻
情報科学研究科
科目
生物情報
年度
2023年度

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大阪大学 情報科学研究科 生物情報の解答PDF2022〜2026年度(5年度)

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第1問 遺伝子発現制御とタンパク質機能

採点上の注意

この問題は語句暗記だけではなく、「DNA の情報が機能性タンパク質になるまでに何段階の制御点があるか」を説明できるかが見られる。転写因子だけを書いて終えると不足である。mRNA の寿命、翻訳効率、修飾、分解まで含めて書くと答案の厚みが出る。

典型ミス

  • 「転写因子が DNA を作る」のように、転写因子とポリメラーゼの役割を混同しない。
  • 翻訳後修飾を「翻訳後にタンパク質が増えること」と書かない。修飾は活性、局在、安定性、相互作用を変える操作である。
  • 酵素以外の機能を問われた場合、酵素の例だけを並べない。

検算の視点

答案を見直すときは、発現量の制御点が 転写前後RNA翻訳タンパク質 \text{転写前後}\quad\text{RNA}\quad\text{翻訳}\quad\text{タンパク質} の少なくとも四層に分かれているかを確認する。さらに、各層で一つずつ具体例を挙げていれば、部分点を取りこぼしにくい。

第2問 細胞周期と細胞分裂

答案の組み立て

M 期の記述では、「M サイクリンがあるから分裂する」だけでは不十分である。高 M-Cdk 活性で M 期へ入り、APC/C による分解で M 期から出る、という上昇と下降の両方を書くとよい。

典型ミス

  • コヒーシンとコンデンシンを逆にしない。接着がコヒーシン、凝縮がコンデンシンである。
  • 後期 A と後期 B をどちらも「染色体が動く」とだけ書かない。A は染色体が極へ近づく過程、B は極どうしが離れる過程である。
  • 植物の細胞質分裂に収縮環だけを書かない。植物では細胞板形成が中心である。

第3問 膜輸送と神経シグナル

符号を間違えないための整理

内側を基準に V=ψin−ψoutV=\psi_{\mathrm{in}}-\psi_{\mathrm{out}} と置く。細胞内が負なら、正イオンを外から内へ入れる電気項は負に働き、正イオンを内から外へ出す電気項は正に働く。Ca2+^{2+} 排出が難しいのは、濃度勾配だけでなく電気的にも内向きに引かれるためである。

検算

Na+^+ を外へ出す操作は濃度勾配にも電位にも逆らうので、1 個あたり数 kcal mol−1\mathrm{kcal\,mol^{-1}} かかる。K+^+ を内へ入れる操作は濃度勾配には逆らうが電位には助けられるため、Na+^+ より小さい値になる。この大小関係になっていれば符号はおおむね正しい。

典型ミス

  • Na+^+/K+^+ ポンプを二次性能動輸送と書かない。ATP を直接使う一次性能動輸送である。
  • グルコース輸送で、SGLT と GLUT の膜局在を逆にしない。
  • シナプス小胞放出で、Na+^+ 流入を直接の放出トリガーとしない。小胞融合の直接トリガーは Ca2+^{2+} 流入である。

第4問 細胞生物学用語

採点されやすい書き方

用語説明では「何であるか」「どこで働くか」「何を変えるか」の三点を短く入れると強い。例えば Ras なら「低分子量 GTPase」「増殖シグナル」「活性型持続で発がん」の三点で骨格ができる。

典型ミス

  • GTP 結合型 Ras を不活性型と書かない。GTP 結合型が活性型である。
  • プロテオグリカンを単なる糖だけの分子としない。タンパク質の芯と糖鎖からなる。
  • スプライソソームをリボソームと混同しない。スプライソソームは RNA の切り貼り、リボソームは翻訳を担う。
  • ヒストン修飾を DNA 配列変化と書かない。配列を変えずにクロマチン状態を変える制御である。

解答

  1. Ras と発がん: Ras は低分子量 GTPase で、GTP 結合型が活性型、GDP 結合型が不活性型である。増殖因子受容体からのシグナルを MAP キナーゼ経路などへ伝える。GTP 加水分解能を失う変異や GAP に応答しにくい変異では活性型が持続し、細胞増殖シグナルが過剰になって発がんに寄与する。
  2. グリコシド結合と細胞壁多糖: グリコシド結合は糖のアノマー炭素と別の水酸基などとの間にできる結合で、多糖の骨格を作る。植物細胞壁のセルロースは β(1→4)\beta(1\to4) 結合で連結したグルコース鎖からなり、直線的で強い微繊維を形成する。結合様式が変わると、多糖の立体構造と分解されやすさが大きく変わる。
  3. グリコサミノグリカンとプロテオグリカン: グリコサミノグリカンは、ウロン酸やアミノ糖を含む二糖単位が繰り返す長い陰性荷電多糖である。硫酸基やカルボキシ基により水を多く保持する。タンパク質の芯に多数のグリコサミノグリカン鎖が結合したものがプロテオグリカンで、細胞外マトリックスの弾性、圧縮抵抗、シグナル因子保持に働く。
  4. ミトコンドリアと葉緑体: ミトコンドリアは酸化的リン酸化により ATP を産生する。内膜の電子伝達系がプロトン勾配を作り、ATP 合成酵素がそれを利用する。葉緑体は光エネルギーを使って ATP と NADPH を作り、炭酸固定に利用する。どちらも二重膜、独自 DNA、リボソームを持ち、細菌に由来する細胞内共生の名残を持つ。
  5. snRNA、snRNP、スプライソソーム: snRNA は核内の小型 RNA で、タンパク質と複合体を作って snRNP になる。複数の snRNP が集合したスプライソソームは、pre-mRNA からイントロンを除去し、エキソンどうしを連結する。塩基対形成によりスプライス部位を認識し、RNA 触媒的な反応を進める。
  6. 形質転換植物、Agrobacterium、カルス: Agrobacterium tumefaciens は Ti プラスミド由来の T-DNA を植物細胞ゲノムへ導入できる。この性質を利用し、目的遺伝子を載せた T-DNA を植物細胞へ入れる。感染または共培養後、選抜培地でカルスを増やし、ホルモン条件を調整して個体へ再分化させると、形質転換植物を得られる。
  7. 分泌小胞、調節性分泌、エキソサイトーシス: 分泌小胞はゴルジ体から生じ、分泌タンパク質や神経伝達物質などを運ぶ。調節性分泌では、小胞は細胞内で待機し、Ca2+^{2+} 上昇などの刺激を受けて膜融合する。エキソサイトーシスでは小胞膜と細胞膜が融合し、内容物が細胞外へ放出される。
  8. 選択的スプライシング: 一つの pre-mRNA から、エキソンの組み合わせを変えた複数の成熟 mRNA を作る仕組みである。同じ遺伝子から異なるタンパク質アイソフォームを作れるため、限られた遺伝子数で細胞種特異的な機能を生み出せる。スプライシング調節因子の結合位置や量により結果が変わる。
  9. クロマチン、ヒストン、ヌクレオソーム: 真核細胞の DNA はヒストンと結合してクロマチンを形成する。ヌクレオソームは、ヒストン八量体の周囲に DNA が巻き付いた基本単位である。ヒストン尾部はアセチル化、メチル化、リン酸化などを受け、クロマチンの開閉、転写因子の結合、遺伝子発現状態を調節する。

最終答

各語は、単独の定義だけでなく、生体内での役割まで結び付けて説明する。特に Ras は発がん、糖鎖は細胞外マトリックス、snRNP はスプライシング、ヒストン修飾は遺伝子発現制御へつなげる。

第5問 DNA ヘリカーゼと老化研究

答案の骨格

この問題では「ヘリカーゼがほどく酵素である」という一文で終えてはいけない。複製停止、DNA 損傷応答、細胞老化、組織機能低下まで因果列で書くと、早老症状とのつながりが明確になる。

採点上の注意

ES 細胞の説明では、単に「遺伝子を入れる」と書くだけでは不足である。相同領域、選抜、正しいクローン確認、胚盤胞注入、キメラ、生殖系列伝達という順番が重要である。

典型ミス

  • 研究計画で測定項目を書かず、抽象的な「老化を調べる」に留めない。
  • 治療法探索で期待結果を寿命延長だけにしない。DNA 損傷、幹細胞機能、炎症、組織機能など中間指標を書く。
  • ヘリカーゼ変異を必ず発がん抑制とだけ結び付けない。細胞死や幹細胞枯渇により、発育不全や組織萎縮も起こりうる。

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年度別の解答例

  • 2026年度

    細胞生物学:細胞内区画・空欄補充・正誤判定 / 生命の系統・観察法・化学結合・DNA複製 / 生物工学の計算:ライブラリ・制限酵素地図・増殖速度・拡散

  • 2025年度

    分子生物学:DNA複製装置・塩基配列決定法・アミノ酸の側鎖 / 生化学・細胞生物学:代謝中間体、シグナル伝達、光合成、細胞分裂 / 生体エネルギー論:ATPの自由エネルギーと細胞スケールの見積もり

  • 2024年度

    細胞生物学:細胞骨格・モータータンパク質・重合を制御する分子 / 細胞生物学:タンパク質の選別輸送と小胞輸送 / 膜輸送の速度論:グルコース輸送体の酵素反応論と定量計算

  • 2023年度(このページ)

    遺伝子発現制御とタンパク質機能 / 細胞周期と細胞分裂 / 膜輸送と神経シグナル

  • 2022年度

    分子生物学:大腸菌の DNA 複製と損傷修復 / 細胞生物学:細胞外マトリックスと上皮の細胞間結合 / 遺伝子工学:核酸塩基の同定と PCR の原理・設計

2023年度の出題内容

大問分野主題解説の小見出し最終答
第1問生物遺伝子発現制御とタンパク質機能採点上の注意 / 検算の視点あり
第2問生物細胞周期と細胞分裂答案の組み立てあり
第3問—膜輸送と神経シグナル符号を間違えないための整理あり
第4問生物細胞生物学用語採点されやすい書き方あり
第5問—DNA ヘリカーゼと老化研究答案の骨格 / 採点上の注意あり

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前年度(2022年度)との違い

大問数
2022年度 5問 → 2023年度 5問

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公開年度範囲
専攻・科目別に掲載(情報基礎数学は2005〜2026年度、情報数理・生物情報は2022〜2026年度など)
公式の解答例
解答例の掲載なし
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