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細胞のシグナル伝達と細胞周期受容体の種類・セカンドメッセンジャー・サイクリンとCDK・チェックポイント

細胞外の信号分子は受容体に結合し、細胞内の酵素の連鎖反応やセカンドメッセンジャーを介して応答を起こす。受容体の占有率は解離定数 KdK_d を使って [L]/(Kd+[L])[\mathrm{L}]/(K_d + [\mathrm{L}]) で表せる。細胞周期は G1\mathrm{G_1}、S、G2\mathrm{G_2}、M の4期からなり、各期への進行はサイクリンと結合したサイクリン依存性キナーゼ(CDK)が駆動し、DNA の損傷や複製・染色体の分配の不備はチェックポイントで検出されて進行が止まる。

細胞生物学 の第2単元(全2単元)。先に読む単元:生体膜の輸送と膜電位

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受容体の種類と細胞内の経路

定義

受容体の分類

  • G タンパク質共役受容体(GPCR):7回膜貫通型。リガンドが結合すると三量体 G タンパク質の α サブユニットが GDP を GTP に交換して活性化する。Gs\mathrm{G_s} はアデニル酸シクラーゼを活性化して cAMP を増やし、cAMP がプロテインキナーゼ A を活性化する。Gq\mathrm{G_q} はホスホリパーゼ Cβ を活性化し、PIP2\mathrm{PIP_2} を IP3\mathrm{IP_3} とジアシルグリセロールに分解する。IP3\mathrm{IP_3} は小胞体から Ca2+\mathrm{Ca^{2+}} を放出させ、ジアシルグリセロールと Ca2+\mathrm{Ca^{2+}} がプロテインキナーゼ C を活性化する。Gi\mathrm{G_i} はアデニル酸シクラーゼを抑える。
  • 受容体型チロシンキナーゼ(RTK):リガンドの結合で二量体になり、互いのチロシン残基をリン酸化する。リン酸化チロシンにアダプタータンパク質が結合し、低分子量 G タンパク質 Ras を活性化して、MAP キナーゼの連鎖反応を経て転写を変える。
  • イオンチャネル型受容体:リガンドの結合でチャネルが開く。ニコチン性アセチルコリン受容体が例。
  • 細胞内受容体:ステロイドホルモンなど膜を通る疎水性の分子が結合し、転写因子として直接遺伝子の発現を変える。

信号は止める仕組みとセットで働く。G タンパク質の α サブユニットは自身の GTP 加水分解活性で不活性型に戻り、cAMP はホスホジエステラーゼで分解され、リン酸化はホスファターゼで外される。酵素が次の酵素を多数活性化する段階が重なるので、少数のリガンドから大きな応答が生じる(シグナルの増幅)。

受容体の占有率と用量反応

定理・法則

受容体の占有率

条件

受容体に結合部位が1つで協同性がなく、結合が平衡に達している。リガンドが受容体への結合でほとんど減らない(遊離リガンド濃度 ≈ 加えた濃度)。

主張

θ=[L]Kd+[L],Kd=[R][L][RL]\theta = \frac{[\mathrm{L}]}{K_d + [\mathrm{L}]}, \qquad K_d = \frac{[\mathrm{R}][\mathrm{L}]}{[\mathrm{RL}]}

[L]=Kd[\mathrm{L}] = K_d で半分の受容体が占有され、占有率 θ\theta にするのに必要な濃度は [L]=Kd θ/(1−θ)[\mathrm{L}] = K_d\,\theta/(1 - \theta) である。

要点

応答の大きさは占有率に比例するとは限らない。増幅があり、一部の受容体が占有されるだけで最大応答に達する場合(予備受容体)、半最大応答の濃度 EC50\mathrm{EC_{50}} は KdK_d より小さくなる。

計算例

占有率から必要なリガンド濃度を出す

Kd=1 nMK_d = 1\ \mathrm{nM} の受容体を90%占有するのに必要なリガンド濃度を求めよ。占有率を10%から90%に上げるには、濃度を何倍にする必要があるか。

解答

[L]=1×0.90.1=9 nM[\mathrm{L}] = 1 \times \frac{0.9}{0.1} = 9\ \mathrm{nM}

10%に必要な濃度は 1×0.1/0.9=1/9 nM1 \times 0.1/0.9 = 1/9\ \mathrm{nM} なので、10%から90%までには濃度を81倍にする。

検算

9/(1+9)=0.99/(1 + 9) = 0.9。協同性のない結合では、占有率を10%から90%に変えるのに濃度が81倍要ることが一般に成り立ち、KdK_d によらない。

細胞周期の各期とサイクリン–CDK

定義

細胞周期

  • G1\mathrm{G_1} 期:細胞が成長し、分裂に進むかを決める。分裂をやめた細胞は G0\mathrm{G_0} 期に入る。
  • S 期:DNA を複製する。核 DNA 量は 2C2C から 4C4C になる(CC は一倍体ゲノムの DNA 量)。
  • G2\mathrm{G_2} 期:分裂の準備をする。DNA 量は 4C4C。
  • M 期:前期・前中期・中期・後期・終期の核分裂と、細胞質分裂。姉妹染色分体が分かれ、娘細胞はそれぞれ 2C2C に戻る。

フローサイトメトリーで細胞ごとの DNA 量を測ると、2C2C(G1\mathrm{G_1})と 4C4C(G2\mathrm{G_2}/M)の山と、その間に広がる S 期の細胞が見える。

定理・法則

サイクリン–CDK による周期の駆動

条件

真核生物の細胞周期。CDK はサイクリンと結合しないと活性をもたない。

主張

CDK の量はほぼ一定で、相手のサイクリンの量が周期に合わせて合成と分解で増減し、それぞれのサイクリン–CDK が対応する期への移行を起こす(哺乳類では G1\mathrm{G_1} のサイクリン D–CDK4/6、G1\mathrm{G_1}/S のサイクリン E–CDK2、S のサイクリン A–CDK2、M のサイクリン B–CDK1)。サイクリンはユビキチン化されてプロテアソームで分解され、M 期のサイクリンの分解を担うのが後期促進複合体(APC/C)である。

要点

CDK の活性は、サイクリンの量のほか、抑制的なリン酸化とその除去(Wee1 と Cdc25)、CDK 阻害タンパク質(p21、p27 など)でも調節される。

チェックポイントと進行を止める仕組み

定義

主なチェックポイント

  • G1\mathrm{G_1}/S(制限点):増殖因子の信号でサイクリン D–CDK4/6 が Rb タンパク質をリン酸化し、Rb が転写因子 E2F を放して S 期の遺伝子が転写される。DNA が損傷していると p53 が安定化して p21 を誘導し、CDK を阻害して周期を止める。
  • G2\mathrm{G_2}/M:DNA の複製が終わっていない、または損傷があると、サイクリン B–CDK1 の活性化を抑えて M 期に入らせない。
  • 紡錘体形成チェックポイント(中期から後期への移行):すべての染色体の動原体が紡錘体の微小管に正しく結合するまで、APC/C の活性化を抑える。結合がそろうと APC/C がセキュリンを分解し、遊離したセパラーゼがコヒーシンを切って姉妹染色分体が分かれる。

これらの経路の遺伝子は、変異で働きを失うと細胞が異常なまま分裂を続けやすくなるので、がん抑制遺伝子(p53、Rb)として知られる。逆に、働きが過剰になると増殖を促す遺伝子(Ras、サイクリン D など)はがん原遺伝子と呼ばれる。

倍加時間と各期の長さの計算

指数増殖
N(t)=N0 2t/T,t=Tlog⁡2NN0N(t) = N_0\,2^{t/T}, \qquad t = T\log_2\frac{N}{N_0}

TT は倍加時間(細胞周期の長さ)。細胞が死なず、すべての細胞が同じ周期で増殖する場合。

最後の期(M 期)の長さ
tM=Tlog⁡2(1+f)≈fT(f≪1)t_M = T\log_2(1 + f) \approx fT \quad (f \ll 1)

ff は M 期にある細胞の割合(分裂指数)。指数増殖する非同調の集団では若い細胞が多い(齢 aa の密度が 2−a/T2^{-a/T} に比例する)ので、割合と時間は単純に比例しない。

計算例

細胞数と M 期の長さ

(1) 倍加時間20時間の細胞を 1×1041 \times 10^{4} 個から 1×1061 \times 10^{6} 個に増やすのに何時間かかるか。(2) この集団の分裂指数が5%のとき、M 期の長さを近似式と正確な式で求めよ。

解答

(1) t=20log⁡2100≈20×6.64≈133t = 20\log_2 100 \approx 20 \times 6.64 \approx 133 時間。

(2) 近似では tM≈0.05×20=1.0t_M \approx 0.05 \times 20 = 1.0 時間。齢の分布を考えると tM=20log⁡21.05≈1.41t_M = 20\log_2 1.05 \approx 1.41 時間で、近似より約4割長い。

検算

(2) 齢の密度 2ln⁡2T2−a/T\dfrac{2\ln 2}{T}2^{-a/T} は 0≤a≤T0 \le a \le T で積分すると1になり、T−tM≤a≤TT - t_M \le a \le T で積分すると 2tM/T−1=f2^{t_M/T} - 1 = f になる。tM=Tt_M = T を代入すると f=1f = 1 になり、全細胞と一致する。

答案でよくある誤り

  1. 1

    CDK の量が周期に合わせて増減するとする。増減するのはサイクリンの量で、CDK はほぼ一定量あり、サイクリンとの結合とリン酸化で活性が変わる。

  2. 2

    G タンパク質共役受容体が自身でリン酸化して信号を伝えるとする。自己リン酸化するのは受容体型チロシンキナーゼで、GPCR は三量体 G タンパク質の GDP–GTP 交換を促す。

  3. 3

    応答の大きさが受容体の占有率に比例するとして EC50=Kd\mathrm{EC_{50}} = K_d とする。増幅や予備受容体があると EC50<Kd\mathrm{EC_{50}} < K_d になる。

  4. 4

    分裂指数に周期の長さを掛ければ、どの期でも正確な長さになるとする。指数増殖する集団では若い細胞が多いので、M 期では Tlog⁡2(1+f)T\log_2(1 + f) を使い、fTfT は ff が小さいときの近似である。

  5. 5

    S 期の細胞の DNA 量を 4C4C とする。S 期は複製の途中で、2C2C と 4C4C の間の値をとる。

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